Resumen
- Leprosis de los cítricos En Colombia se mostró anteriormente. a ser causada por citoplasma Virus de la leprosis de los cítricos(CiLV-C). En 2011, los métodos de diagnóstico basados en la reacción de la cadena de la polimerasa de transcripción inversa (RT-PCR) ligados a enzimas fallarona identificar CiLV-C de agrios muestras con síntomas similares a la leprosis cítrica; sin embargo, virionesSimilar a CiLV-C se observaron en lacitoplasma delHojas sintomáticas por microscopía electrónica de transmisión. Además,la organismo causal fue transmitido por la ácaro falso, Brevipalpus phoenicis, a sano agrios plántulas UNA biblioteca de Se construyeron pequeños ARN a partir de hojas sintomáticas y se usaron como la Plantilla para la secuenciación paralela de alto rendimiento de Illumina. los secuencia completa del genoma y estructura de un nuevo ARN bipartito virusestaba determinado. RNA1 (8,717 nucleótidos [nt]) contenía dos marcos de lectura abiertos (ORF). Codificado ORF1la módulo de replicación, que consiste decinco dominios: a saber, metiltransferasa (MTR), cisteína proteasa, FtsJ-MTR, helicasa (Hel) y ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp); mientras que ORF2 codificadolasupuesta capa de proteína. RNA2 (4,989 nt) contenía cinco ORFs que codificanla proteína de movimiento (MP) y cuatro proteínas hipotéticas (p7, p15, p24 y p61). los estructura de esta virus el genoma se parecía a eso de CiLV-C excepto que contenía unaregión terminal no traducida 3 'larga y un ORF adicional (p7) en RNA2. Ambosla RNA1 y RNA2 del nuevo virus tenía solo 58 y 50% de identidades de nucleótidos, respectivamente, con secuencias conocidas de CiLV-C y, por lo tanto, aparece a ser un nuevo virus infectando agrios. Análisis filogenéticosdel Los dominios MTR, Hel, RdRp y MP también indicaron que la nuevo virusestaba estrechamente relacionado aCiLV-C. Sugerimos queEl virus ser llamado Virus de la leprosis de los cítricos tipo 2 citoplásmico (CiLV-C2) y debe clasificarse inequívocamente como una miembro definitivo del género Cilevirus. UNA par de CiLV-C2 genoma específico RT-PCR primers fue diseñado y validado a detectar su presencia en leprosis de los citricos muestras recolectadas de la Casanare y estados meta en colombia.