Variabilidade genética de isolados de badnavírus infectando inhame (Dioscorea spp.) no nordeste do Brasil - Academic Article uri icon

Resumen

  • Las enfermedades causadas por virus del género Badnavirus son responsables de grandes pérdidas en cultivos de ñame en el noreste de Brasil. El conocimiento de la variabilidad del patógeno puede proporcionar información importante sobre su potencial evolutivo y puede permitir el desarrollo de mejores estrategias para el manejo de la enfermedad. El análisis de 425 muestras de hojas de ñame obtenidas en 2010 en tres estados del noreste de Brasil reveló una alta incidencia (93.3%) de badnavirus. Para evaluar la variabilidad de los badnavirus que infectan el ñame, un fragmento de 579 nucleótidos correspondiente a la región codificante de la transcriptasa inversa (RT) / RNasaH se amplificó por PCR y se secuenció directamente. El análisis filogenético de las secuencias de nucleótidos reveló que los aislamientos se pueden dividir en dos grupos. El primer grupo está altamente relacionado conDioscorea baciliform AL virus(DBALV), mientras que el otro conjunto de secuencias formó un clado altamente divergente dentro del género Badnavirus . Los aislados de DBALV tienen 70-98% de identidad de secuencia de nucleótidos entre sí. Se detectó DBALV en todas las áreas evaluadas y en las dos especies de ñame más cultivadas en el noreste ( D. alata y D. cayanensis ). El otro grupo comparte 47-58% de identidad de secuencia de nucleótidos con los aislados de DBALV y 78-95% entre ellos, y se encontró solo en D. alata en el estado de Paraíba.

Fecha de publicación

  • 2013