Capítulo: Applications of Molecular Docking and Molecular Dynamics on the Inhibition of Quorum Sensing Systems - Advances in Mathematical Chemistry and Applications Academic Article uri icon

Resumen

  • English

    Owing to the evolution of resistant cells using standard antimicrobial methods, it is necessary for us to find alternative strategies to block the attack without exerting pressures on their duplicated structures and in some cases degradation of their Quorum Sensing signals is suggested to be more efficient. In this chapter, we give a brief introduction of quorum sensing basics. Then, we describe the computational approaches that are used to find molecules to inhibit the chemical signals. After that, we present the case studies using these computational methods. In one of the cases performed in E. coli with the autoinducer molecule indole, we elaborate how to evaluate and find molecules with the ability to degrade the indole. We present another case where biological molecules with potential ability to degrade the autoinducer 3-OH-PAME Quorum Sensing system in R. solanacearum were evaluated as potential quenchers.

    Español

    Debido a la evolución de las células resistentes utilizando métodos antimicrobianos estándar, es necesario encontrar estrategias alternativas para bloquear el ataque sin ejercer presiones sobre sus estructuras duplicadas y en algunos casos se sugiere que la degradación de sus señales de Quórum Sensing es más eficiente. En este capítulo, ofrecemos una breve introducción de los conceptos básicos de detección de quórum. A continuación, describimos los enfoques computacionales que se utilizan para encontrar moléculas para inhibir las señales químicas. Después de eso, presentamos los estudios de casos utilizando estos métodos computacionales. En uno de los casos realizados en E. coli con la molécula del autoinductor indol, elaboramos cómo evaluar y encontrar moléculas con la capacidad de degradar el indol. Presentamos otro caso en el que las moléculas biológicas con capacidad potencial para degradar el autoinductor 3-OH-PAME Quorum Sensing sistema en R. solanacearum se evaluaron como potenciales apagadores.

Fecha de publicación

  • 2015

Enfoque geográfico