Burrowing nematodes from Colombia and their relationship with Radopholus similis populations, R. arabocoffeae and R. duriophilus- Book uri icon

Resumen

  • Se caracterizaron dos poblaciones de nematodos excavadores de Colombia utilizando criterios morfológicos, morfométricos y moleculares. Los caracteres morfológicos y morfométricos de las dos poblaciones no difirieron de los de Radopholus similis. El análisis filogenético basado en la comparación de secuencias de las regiones 18S, D2D3 de estas poblaciones con las de Radopholus sp., R. similis y otros Tylenchomorpha de GenBank confirmó la estrecha relación molecular entre el género Radopholus y Hoplolaimidae. El árbol de consenso basado en la comparación de las secuencias de ADNr ITS1-5.8-ITS2 de las poblaciones colombianas con R. similis (muchas fuentes), R. arabocoffeae y R. duriophilus de GenBank agruparon las poblaciones colombianas en un clado que también incluyó R. similis de diferentes localidades. Otras poblaciones de R. similis agrupadas en clados separados, que estaban estrechamente relacionados con el clado que contiene R. arabocoffeae y R. duriophilus. La alta variabilidad genética entre las poblaciones de R. similis fue observada y confirmada por la alta divergencia en la secuencia ITS1-5.8-ITS2 dentro de las poblaciones estudiadas de R. similis (5.4%) que fue comparable a la divergencia (4.2-6.9%) entre el Radopholus Especies incluidas en el análisis. Estos hallazgos y la colocación filogenética no resuelta de R. arabocoffeae y R. duriophilus entre R. similis sugieren que el nematodo excavador podría ser un complejo de especies. La información limitada sobre la variabilidad de las regiones 18S y D2D3 da una indicación de su posible valor, además de ITS1-5.8-ITS, como marcadores moleculares dentro de Radopholus.

Fecha de publicación

  • 2010