Estudios sobre el ecosistema microbiano ruminal, han requerido tradicionalmente el uso de la canulación de los animales. El alto costo de la cirugía y su mantenimiento ha limitado a muchos laboratorios a tener fácil acceso a las muestras del rumen y a explorar su diversidad microbiana. Métodos como el uso de sondas de oro- ruminales se han utilizado tradicionalmente para transformación de animales sanos y otros que tienen enfermedades metanbólicas; que también han sido utilizadas en para el diagnóstico de enfermedades severas: síndrome de abomaso reflejo, acidosis láctica aguda, la acidosis crónica latente, putrefacción y la inactividad microbiana.
