Linkage disequilibrium, persistence of phase, and effective population size in Spanish local beef cattle breeds assessed through a high-density single nucleotide polymorphism chip.- Academic Article uri icon

Resumen

  • El desequilibrio de ligamiento (LD) y la persistencia de la fase son enfoques fundamentales para explorar la base genética de rasgos económicamente importantes en el ganado, incluida la identificación de QTL para la selección genómica y la estimación del tamaño efectivo de la población () para determinar el tamaño de las poblaciones de entrenamiento. En este estudio, hemos utilizado el chip Illumina BovineHD en 168 tríos de 7 razas de ganado vacuno español para obtener una visión general de la magnitud de LD y la persistencia de la fase LD a través de la distancia física entre marcadores. Además, estimamos el tiempo de divergencia en función de la persistencia de la fase de LD y calculamos el pasado a partir de estimaciones de LD utilizando diferentes alternativas para definir la tasa de recombinación. Las estimaciones del promedio (como medida de LD) para los marcadores adyacentes fueron cercanas a 0.

Fecha de publicación

  • 2016