Genomic comparison between Xanthomonas oryzae pv. oryzae and Xanthomonas oryzae pv. oryzicola, using suppression subtractive hybridization- Academic Article uri icon

Resumen

  • Xanthomonas oryzae pathovar oryzae (Xoo) y X. oryzae pv. La oryzicola (Xoc) causa enfermedades bacterianas en el arroz: el tizón de la hoja y la raya de la hoja, respectivamente. Aunque tanto la cepa asiática como la africana de Xoo inducen síntomas similares, son genéticamente diferentes, ya que las cepas africanas Xoo están más estrechamente relacionadas con la Xoc asiática. Para identificar las secuencias responsables de las diferencias entre las cepas Xoo africanas y asiáticas y su relación con las cepas Xoc, se realizó un procedimiento de hibridación supresión-sustractiva (SSH), utilizando la cepa African Xoo MAI1 como probador y la cepa Philippine Xoo PXO86 y Xoc BLS256. colar como conductores. Se generó un conjunto no redundante de 134 secuencias de MAI1. Varios fragmentos de ADN aislados por SSH fueron similares a los genes de función desconocida, proteínas hipotéticas, genes relacionados con el sistema de secreción tipo III y otros genes relacionados con la patogenicidad.
  • Xanthomonas oryzae pathovar oryzae (Xoo) y X. oryzae pv. La oryzicola (Xoc) causa enfermedades bacterianas en el arroz: el tizón de la hoja y la raya de la hoja, respectivamente. Aunque tanto las cepas asiáticas como las africanas de Xoo inducen síntomas similares, son genéticamente diferentes, ya que las cepas africanas Xoo están más estrechamente relacionadas con la Xoc asiática. Para identificar las secuencias responsables de las diferencias entre las cepas Xoo africanas y asiáticas y su relación con las cepas Xoc, se realizó un procedimiento de hibridación supresión-sustractiva (SSH), utilizando la cepa African Xoo MAI1 como probador y la cepa Philippine Xoo PXO86 y Xoc BLS256 esforzarse como conductores

Fecha de publicación

  • 2010