Fine mapping by composite genome-wide association analysis - Academic Article uri icon

Resumen

  • Los estudios de asociación de genoma (GWA) desempeñan un papel clave en la investigación genética actual, desentrañando las regiones genómicas relacionadas con rasgos fenotípicos de interés en múltiples especies. Sin embargo, el grado de desequilibrio de ligamiento (LD) puede proporcionar resultados confusos cuando los marcadores genéticos significativos se extienden a lo largo de varios cM contiguos. En este estudio, hemos adaptado el enfoque de mapeo de intervalo compuesto al marco GWA (GWA compuesto), para evaluar el impacto de incluir marcadores genéticos competidores (posiblemente vinculados) al probar el efecto alélico aditivo inherente a un marcador genético dado. Probamos el rendimiento del modelo en conjuntos de datos simulados en diferentes escenarios (es decir, efectos de loci de rasgos cualitativos, LD entre los marcadores genéticos y el ancho de la región genómica involucrada en el análisis)

Fecha de publicación

  • 2017