Molecular and biological characterization of cowpea mild mottle virus isolates infecting soybean in brazil and evidence of recombination- Academic Article uri icon

Resumen

  • La caracterización biológica y molecular de seis aislamientos de una nueva cepa del virus del moteado leve de caupí (CPMMV; Carlavirus, Betaflexiviridae).) Están reportados. Se recolectaron plantas de soya con mosaico y necrosis del tallo en los estados de Bahía, Goiás, Mato Grosso y Minas Gerais, Brasil. Los genomas completos de los aislados de CPMMV tienen una longitud de 8180–8198 nucleótidos (nt), excluyendo la cola 3'-poliadenilada, y tienen una identidad de secuencia de 67–68% nt con un aislado de Ghana de CPMMV, el único aislado de CPMMV para el cual el genoma ha ha sido secuenciado La replicasa tiene solo 60–61% de identidad de secuencia de nt con el aislado de Ghana CPMMV, y la proteína de la cubierta (CP) está altamente conservada (79% de identidad de secuencia de nt y 95–96% de identidad de secuencia de aminoácidos). La alta identidad de CP y los análisis filogenéticos apoyaron la clasificación de los aislamientos brasileños como CPMMV. Se encontraron diferencias biológicas y moleculares con el aislado de CPMMV de Ghana e indicaron que los seis aislamientos representan una cepa distinta de CPMMV denominada CPMMV-BR. Además, se muestra que la recombinación se produjo principalmente en el gen de la polimerasa, y puede ocurrir con menos frecuencia en otras regiones del genoma de CPMMV.

Fecha de publicación

  • 2013