Análisis de asociación genómica para identificación de variantes tipo snp asociados con resistencia a parasitos gastrointestinales en ovinos criollos Academic Article uri icon

Resumen

  • Una limitante importante en los sistemas de producción ovina es el control de parásitos gastrointestinales, debido al uso indiscriminado de métodos de control químico poco efectivos. Objetivo: este trabajo se realizó con el fin de identificar las variaciones del ADN sobre las características fenotípicas asociadas con carga de parásitos gastrointestinales e índices de anemia en ovinos mediante un análisis de asociación genómica. Métodos: se registro información para variables fenotípicas (FAMACHA, hematocrito, hemoglobina, recuento de Eimeria spp., recuento de huevos fecales) y se construyó un índice de anemia. La información se registró durante dos años en 180 animales de las razas Criolla y Mora colombiana, se seleccionaron animales con fenotipos extremos (n=40) que fueron usados para genotipado a gran escala (chip Ovine SNP50 BeadChip). Resultados de información fenotípica y genotipado fueron analizados mediante la metodología ssBLUP utilizando una matriz de relaciones genómicas para estimar el efecto de cada uno de los SNP’s. Resultados: para la característica FAMACHA los cromosomas 3 y 6 presentaron el mayor número de SNP significativos (p<1.0e-7) con 16 y 11 SNP’s respectivamente; para el nivel de hematocrito y hemoglobina los cromosoma 4 y 7 (con 21 y 17 SNP’s respectivamente), para el conteo de huevos de Eimeria spp. el cromosoma 2 presentó 23 SNP’s significativos. Finalmente el índice de anemia presentó el mayor efecto sobre los cromosomas 4, 6 y X (con 10,12 y 12 SNP’s, respectivamente). Los cromosomas 2, 4 y 7 presentaron el mayor número de SNP’s significativos (46, 68 y 42 SNP’s, respectivamente). Para la variable hematocrito, el SNP de mayor significancia (cromosoma 7) se encuentra dentro del gen ATP8B4, el cual es descrito como ATPasa, que participa en el transporte de fosfolípidos a la membrana celular. Para conteo de huevos de Eimeria spp, el SNP más significativo (cromosoma 8) se encuentra dentro del gen AKAP12 y corresponde a una quinasa (PRKA). Conclusión: se identificaron regiones genómicas que presentan una asociación altamente significativa con características asociadas a parasitismos gastrointestinales en ovinos, esta información en el futuro pueden ser utilizada para selección asistida por marcadores moleculares.

Fecha de publicación

  • 2013