Identification of genes in cassava that are differentially expressed during infection with Xanthomonas axonopodis pv. manihotis Academic Article uri icon

Resumen

  • El enfoque de polimorfismo de longitud de fragmento amplificado de cDNA se utilizó para identificar transcripciones expresadas diferencialmente de yuca infectada por Xanthomonas axonopodis pv. manihotis (xam). Se rastrearon aproximadamente 3600 fragmentos derivados de transcripción (TDF) de los cuales 340 se aislaron. Las secuencias de nucleótidos de 250 TDF se analizaron y ensamblaron en contigs y singletons. Las secuencias de aminoácidos de sus productos predichos se compararon con las entradas en las bases de datos y 63 de estos clones mostraron homología con genes de plantas conocidos. De estos, 32 mostraron similitud con las proteínas de defensa de las plantas. Cincuenta y un TDF correspondieron a proteínas de función desconocida y 106 no coincidieron con ninguna secuencia en las bases de datos públicas.

Fecha de publicación

  • 2002