Resumen
- Colombia ocupa el puesto 18 en el mundo en producción de cítricos y contribuyó con el 0.9% de la participación mundial total. Entre las cuatro regiones productoras de cítricos importantes de Colombia, la región del Orinoco (3 a 6 ° N, 68 a 74 ° W) consiste en dos estados productores de cítricos, Meta y Casanare. La leprosis de los cítricos es la enfermedad viral más importante de los cítricos en Colombia (1,3). Tres tipos de virus de la leprosis de los cítricos (CiLV, por sus siglas en inglés) infectan a los cítricos y producen síntomas de lesiones similares a la leprosis. Dos de las tres especies de CiLV, el tipo citoplásmico del virus de la leprosis cítrica (CiLV-C) y el tipo 2 citoplásmico (CiLV-C2), producen partículas solo en el citoplasma (3). La otra especie, el tipo nuclear del virus de la leprosis de los cítricos (CiLV-N), produce partículas tanto en el citoplasma como en el núcleo (4). CiLV-C es más prevalente y destructivo, mientras que CiLV-N se ha informado solo en Brasil, Panamá y México (4). Curiosamente, Tanto el CiLV-C como el C2 se informaron en las mismas regiones de los estados de Meta y Casanare en Colombia en 2004 y 2012 (1,3). Las lesiones de CiLV-C generalmente son redondeadas (inicialmente de 2 a 3 mm de diámetro y se extienden hasta 30 mm), tienen manchas cloróticas centrales de color marrón oscuro o verdosas, y están rodeadas de halos amarillos. Las lesiones de CiLV-N se han descrito como de tamaño más pequeño y forman tres regiones bien definidas que incluyen un centro necrótico con un halo de color naranja intermedio y un halo clorótico externo (2). En 2013, se recolectaron hojas de naranja dulce de Valencia (Citrus sinensis L.) con síntomas sospechosos de CiLV-N de 8 plantas en el estado de Casanare y se enviaron bajo permiso al USDA-APHIS-PPQ-CPHST, Beltsville, MD. El ARN total de hojas de naranja dulce sintomáticas y saludables se extrajo utilizando el Mini Kit de RNeasy Plant (Qiagen, Valencia, CA). Cebadores de RT-PCR específicos para CiLV-C, CiLV-C2 (3) y CiLV-N nucleocápside (N) (CiLV-N-NPF: 5′-ATGGCTAACCCAAGTGAGATCTTGTTTTl.Traducciones) -3 'y los genes putativos de la proteína de la matriz (M) (CiLV-N-MF: 5′-ATGTCTAAACAGATTAATATGTGCACTGTG-3'; CiLV-N-MR: 5′-CTAACCACTGGGTCCCGC-3 ') para identificar el CiLV asociado con el CiLV asociado al Muestras de hojas afectadas por leprosis de Casanare. RT-PCR con cebadores CiLV-C no logró producir ningún amplicón, pero los cebadores CiLV-N amplificaron con éxito el gen parcial de N (681 pb) y el gen M completo (552 nt) de múltiples hojas de todas las muestras de leprosis. Además, un amplificador de 795 pb específico para CiLV-C2 también se amplificó a partir de las muestras sospechosas de CiLV-N. Se obtuvieron resultados similares cuando el vector, el araña plana (Brevipalpus spp.) Total de ARN se usó como plantilla para la RT-PCR. Para mayor confirmación, cada amplicón fue clonado y secuenciado. La secuenciación de los amplicones de los genes N y M de CiLV-N (números de acceso KJ195893 y KJ195894) y el gen de la proteína de la cubierta de CiLV-C2 mostró una identidad de secuencia de nucleótidos de 97 a 99% con la secuencia de aislamiento de CiLV-N M2345 (KF209275) de México ( 4) y la secuencia de aislamiento CiLV-C2 L147V1 (JX000024) de Colombia (3), respectivamente. Los análisis filogenéticos de estas secuencias de genes de proteínas N y M confirmaron una infección mixta de la misma planta con dos virus, uno de un nuevo género no asignado Dichorhavirus (CiLV-N) y otro del género Cilevirus (CiLV-C2). Este es el primer informe de CiLV-N en Colombia, y también el primer informe de una aparición de CiLV-N en la infección mixta con CiLV-C2. Las tres especies conocidas de CiLV se encuentran en la región del Orinoco de Colombia. Referencias: (1) MG León et al. Planta de dis. 90: 682, 2006. (2) JPR Marques et al. Anais da Academia Brasileira de Ciências 82: 501, 2010. (3) A. Roy et al. Fitopatología 103: 488, 2013. (4) A. Roy et al. Anuncio del genoma. 1 (4): e00519-13, 2013.