BackCLIP: a tool to identify common background presence in PAR-CLIP datasets - Book uri icon

Resumen

  • PAR-CLIP, un protocolo CLIP-seq, deriva un amplio conjunto de sitios de unión de transcriptoma para proteínas de unión a ARN. A pesar de que el protocolo utiliza un lavado riguroso para eliminar el ruido experimental, parte de él permanece. Un estudio reciente midió tres conjuntos de fondos de ARN no específicos que están presentes en varios conjuntos de datos PAR-CLIP. Sin embargo, aún no está disponible una herramienta para identificar la presencia de antecedentes comunes en los conjuntos de datos PAR-CLIP.

Fecha de publicación

  • noviembre 15, 2015