Para determinar la eficiencia de emisión y el comportamiento histórico (1990-2020) de la relación entre las emisiones de gases con efecto invernadero (GEI) de los cultivos de caña de azúcar, café, banano y arroz, con respecto al valor bruto de la producción, se estimó la emisión de GEI de la actividad primaria, sin incluir hidrocarburos, y se recopiló información productiva y del valor bruto de la producción (VBP) expresado en colones nominales y reales. Para cada cultivo se calculó anualmente la eficiencia de emisión y, se estableció la relación de la emisión con el VBP. Al comparar la eficiencia de emisión del 2020 con la de 1990, esta mejoró poco en caña de azúcar (-0,30 kg de CO2eq t-1 tallos cosechados) y arroz (-0,56 t de CO2eq t-1 de arroz cosechada), y en mayor grado en banano (-8,9 kg de CO2eq t-1 de fruta exportada); el café incrementó el valor en 13,1 kg de CO2eq fanega-1 cosechada. La relación de la emisión con el VBP nominal en todos los cultivos se redujo sustancialmente, indicando que cada vez se emite menos GEI por cada millón de colones recibido. En el caso del VBP real, la caña de azúcar y el banano tienden a emitir menos con cada millón de colones, mientras que el arroz muestra cierto grado de estabilidad y, el café la incrementa. En términos generales la participación de la emisión GEI proveniente de estos cultivos ha representado al menos 75% del total nacional del sector agrícola, con tendencia a la reducción con el tiempo. Se evidencia la necesidad de continuar el incremento de la productividad de estos cultivos y la reducción de los GEI como una forma de mejorar los índices analizados, y con ello desarrollar sistemas de producción acordes con las exigencias actuales de comercialización.