La Estación Experimental Agraria San Roque tiene como principal función ejecutar acciones de innovación agraria en recursos genéticos vegetales, biotecnología vegetal, arroz, cultivos andinos, frutales, maíz, raíces y tuberosas, agroforestería, rehabilitación de ecosistemas degradados, camu camu. Así como realizar la  producción de semillas y plantones.